病毒、木马、和一些恶意软件，往往都会对Widnows的注册表下毒手，虽然破坏形式不尽相同，但是经过分析它们的破坏手法并非无规律可循。这里列出了一些用户系统中被易被修改的系统设置和注册表项。建议再换用其他木马专杀工具试一下，并再针对以下注册表键值进行检查，看看是否有被改动过的迹象。

系统设置文件

对于Widnows 9X系统，常见的是病毒修改可能会更改autoexec.bat，只要在其中加入执行病毒程序文件的语句即可在系统启动时自动激活病毒。*更改 drive:\windows\win.ini或者system.ini文件。病毒通常会在win.ini的“run=”后面加入病毒自身的文件名，或者在system.ini文件中将“shell=”更改。

注册表键值

目前，只要新出的蠕虫/特洛伊类病毒一般都有修改系统注册表的动作。它们修改的位置一般有以下几个地方:

在系统启动时自动执行的程序
HKLM\Software\Microsoft\Windows\CurrentVersion\RunOnce\

在系统启动时自动执行的系统服务程序
HKLM\Software\Microsoft\Windows\CurrentVersion\RunServices\

在系统启动时自动执行的程序，这是病毒最有可能修改/添加的地方
HKLM\Software\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Run\???? HKEY_CLASSES_ROOT\exefile\shell\open\command

说明:此键值能使病毒在用户运行任何EXE程序时被运行，以此类推，..\txtfile\.. 或者 ..\comfile\.. 也可被更改，以便实现病毒自动运行的功能。

另外，有些健值还可能被利用来实现比较特别的功能:

有些病毒会通过修改下面的键值来阻止用户查看和修改注册表:
　　 HKCU\Software\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Policies\System\DisableRegistryTools=

通过对以上地方的修改，病毒程序主要达到的目的是在系统启动或者程序运行过程中能够自动被执行，已达到自动激活的目的。